La Iglesia de San Pablo, o del Colegio, forma parte del edificio que actualmente alberga el Seminario de San Pedro y San Pablo y el Museo Pío XII de Braga, y fue construida por la Compañía de Jesús bajo los auspicios del Arzobispo Frei Bartolomeu dos Mártires y del Cardenal-Rey de Portugal.

En palabras de Robert C. Smith, esta iglesia es el santuario del arte de Braga, donde se conserva lo mejor del arte barroco producido en Braga durante los reinados de Pedro II y João V.