O Mosteiro de S. Pedro de Pedroso, conxunto monástico de case mil anos, sería fundado a principios do século XI, xa que a primeira referencia documental remóntase ao ano 1046, por Ederonito Alvites e a súa muller D. Transtina Pinianiz. segundo as observancias monásticas peninsulares. Resistíase á adopción da Regra de San Bieito e ás normas de Cluny, pero acabou por adherirse a ela en 1115-1120.
Coa reforma das ordes relixiosas no século XVI ingresou no Colexio de Xesús de Coimbra, máis precisamente en 1560.
En 1759 a propiedade foi dividida: a igrexa do Mosteiro continuou como igrexa parroquial principal e o resto da propiedade foi cedida á Hacienda da Universidade de Coimbra, que a vendeu a particulares en 1803.
En 1929 realízanse os traballos de ampliación da igrexa, afastándoa das murallas, construíndo unha torre na esquina sur-suroeste e adiantando a muralla fronteiriza e tamén a casa conventual para adecuala á vivenda, á explotación agrícola e á cría de cabalos. . Está catalogado como Monumento de Interese Público.