Em 1525, D. João de Coimbra determinou edificar uma capela privada, sob a invocação de Nossa Senhora da Conceição, que ficaria conhecida como Capela dos Coimbras. Teve traça de autoria dos mestres biscainhos, construtores do Palácio dos Biscainhos.

A capela, adossada à Igreja de São João do Souto, chegou a ter em anexo a ermida de Santo António dos Esquecidos.

Foi classificada como Monumento Nacional em 1910.

Em 1906, o palacete dos Coimbras foi demolido, devido à reformulação urbana daquela zona, tendo-se criado o Largo São João do Souto. Mas os elementos arquitetónicos manuelinos são preservados e, em 1924 o edifício é reconstruído do lado oposto da rua, em continuidade com a capela.

Atualmente, na Casa dos Coimbras, está instalado um bar/restaurante.