Propriedade da Ordem Franciscana Secular, a sua estrutura data do séc. XIII (1271). A sua fundação é atribuída segundo a tradição oral a S. Francisco de Assis. Foi reedificado na primeira metade do sec. XIII a partir de uma estrutura medieval de que subsistem elementos. A fachada maneirista data de 1635. Todo o convento sofreu novas intervenções ao longo de setecentos. Em 1800 a fachada da igreja foi renovada. Na 2.ª metade do séc. XIX, na zona conventual, depois de sujeita a obras de readaptação, instalou-se o Hospital Militar. Após o restauro da igreja ficaram a descoberto alguns frescos medievais. Foi importante ponto de passagem da rota de peregrinos que se dirigiam para Santiago de Compostela. Parte do convento é hoje o Arquivo Distrital de Bragança e é possivel visitar.