La fundación de la Santa Casa de la Misericordia de Bragança debe remontarse al año 1518 y «se fundó en una iglesia que había dedicado al Espíritu Santo» (que daba nombre a la calle). El templo fue reconstruido en 1539, para servir como iglesia de la Misericordia. En los fines del siglo XVII, el altar mayor sería dotado con un valioso retablo manierista (como figura central N. S. de la Misericordia). En una capilla anexa, puede admirarse una bella imagen del Señor de los Pasos, de los fines del siglo XVIII. El revestimiento a azulejos de la frontera es de la segunda mitad del siglo XIX.